下痢がひどい時は、一旦ビタミーナの摂取を控えるのが無難だと思います。

理由

ビタミーナの成分（ビタミンC・マグネシウム）が下痢を悪化させる可能性が無いとは言えないからです。

まずは腸の回復を優先して下さい。
下痢が続くと栄養吸収が低下するため、まずは腸の状態を整えることが大切です。

下痢が落ち着いたら、少量ずつ再開し、問題がないか様子を見ながら調整すると良いでしょう。